18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0686 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  84.9 
 
 		 457 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 475 aa  947    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  70.02 
 
 		 454 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  47.3 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.3 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  24.54 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  26.57 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.73 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.7 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.99 
 
 		 338 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.64 
 
 		 223 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  27.35 
 
 		 302 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.59 
 
 		 338 aa  53.5  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.7 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.59 
 
 		 303 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  26.59 
 
 		 303 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.24 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  24 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>