19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1277 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  487  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  69.78 
 
 
239 aa  345  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  66.24 
 
 
234 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  64.91 
 
 
251 aa  330  9e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.486617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  62.39 
 
 
234 aa  330  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  61.11 
 
 
234 aa  329  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  30.67 
 
 
246 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  28.33 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  29.44 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.27 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  27.88 
 
 
237 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  28.18 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  26 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  24.49 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  26.13 
 
 
296 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.15 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  24.58 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6874  hypothetical protein  37.65 
 
 
559 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140974  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1096  hypothetical protein  32.81 
 
 
543 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>