41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1406 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  100 
 
 		 362 aa  712    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  31.82 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.71 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  27.82 
 
 		 240 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  23.76 
 
 		 254 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  23.76 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  26.92 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  24.87 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.5 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  29.51 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  27.27 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  34.26 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  31.94 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  31.25 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  27.12 
 
 		 784 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  28.81 
 
 		 289 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29.29 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  32.43 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.03 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  30.3 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  26.95 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  28.66 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  28.66 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1578  PGAP1 family protein  25.83 
 
 		 672 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.45 
 
 		 195 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  32.46 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2143  hydrolase/lipase  29.55 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  25.27 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.9 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 		 958 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  27.06 
 
 		 211 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  26.9 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>