72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1657 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1044    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  40.12 
 
 		 958 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3751  ATP/GTP-binding protein  41.88 
 
 		 702 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 785 aa  73.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 911 aa  72  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  29.96 
 
 		 845 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  29.13 
 
 		 838 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 1262 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 1000 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 		 1146 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  29.13 
 
 		 675 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.6 
 
 		 1261 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 		 1185 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.33 
 
 		 992 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  28.71 
 
 		 1136 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 1050 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  25.6 
 
 		 1500 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 		 1324 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  28.86 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 1128 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  28.64 
 
 		 934 aa  57  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  30.11 
 
 		 849 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  27.87 
 
 		 900 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  30.25 
 
 		 843 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 992 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1039 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  34.55 
 
 		 1326 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  27.15 
 
 		 897 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.53 
 
 		 1314 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  26.92 
 
 		 362 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.31 
 
 		 793 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 591 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1383 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 		 1056 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 957 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1068 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2232  hypothetical protein  25.51 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000103157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.57 
 
 		 899 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  27.76 
 
 		 952 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 966 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.26 
 
 		 829 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1523 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1212 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  52.27 
 
 		 591 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.13 
 
 		 1309 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2478  PGAP1 family protein  24.85 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 1424 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.84 
 
 		 1064 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 914 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  28.1 
 
 		 1509 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  32.97 
 
 		 996 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 906 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 		 1311 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 1058 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1285 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.27 
 
 		 822 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  30.07 
 
 		 713 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 953 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 601 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 941 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  26.07 
 
 		 916 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.78 
 
 		 1125 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.06 
 
 		 701 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  26.67 
 
 		 918 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 950 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.05 
 
 		 2145 aa  43.9  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  41.56 
 
 		 1060 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  31.9 
 
 		 1131 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1088 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>