20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2143 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2143  hydrolase/lipase  100 
 
 
336 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3957  hypothetical protein  43.9 
 
 
326 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1595  putative lipoprotein  37.8 
 
 
336 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  26.05 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  25.6 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  29.55 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  28.57 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.61 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  38.24 
 
 
459 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  24.81 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  33.05 
 
 
294 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  25 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  34.94 
 
 
2159 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>