11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1057 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1057  lipase, class 2  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.24448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  31.2 
 
 		 338 aa  91.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.57 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.86 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  22.51 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  30.51 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  26.85 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  21.95 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  30.12 
 
 		 422 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  25.33 
 
 		 342 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>