109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2358 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  98.28 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  89.58 
 
 		 294 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  84.48 
 
 		 290 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  67.71 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  65.62 
 
 		 292 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  63.54 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  54.14 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  28.3 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  28.3 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.54 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  27.17 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  24.24 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  26.12 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  25.98 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  25.19 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  26.01 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  26.89 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  25.57 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  25.37 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.09 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  25.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  25.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  25.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  25.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  25.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  25.46 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  25.77 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  25.77 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  25.09 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  26.87 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  25.76 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  25.76 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  25.76 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  24.73 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  24.73 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.37 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  29.02 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  28.64 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  23.74 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  26.22 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  25.37 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25 
 
 		 444 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  26.7 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.25 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.48 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  18.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.64 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  23.29 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>