131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3652 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  97.04 
 
 
270 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  78.15 
 
 
267 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  73.61 
 
 
269 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  72.62 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  72.62 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  73.51 
 
 
269 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  72.24 
 
 
262 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  71.1 
 
 
262 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  68.52 
 
 
268 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  41.31 
 
 
279 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.76 
 
 
261 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.76 
 
 
261 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  38.08 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  39.46 
 
 
273 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
273 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.47 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  37.83 
 
 
267 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  39.53 
 
 
275 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  39.69 
 
 
273 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  38.7 
 
 
275 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  38.7 
 
 
275 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  37.02 
 
 
267 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  39.3 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  39.3 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
267 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  39.3 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  39.3 
 
 
281 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  38.91 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  38.91 
 
 
281 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  38.7 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  39.3 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  38.35 
 
 
280 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  34.13 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
271 aa  148  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  36.72 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  35.16 
 
 
289 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
275 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  34.26 
 
 
269 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.15 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.21 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  30.65 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
279 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
292 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
294 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.92 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  27.24 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.74 
 
 
444 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  33.33 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  22.12 
 
 
390 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363686 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  22.22 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  26.45 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  34.44 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.04 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  23.22 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  33.33 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
252 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.12 
 
 
266 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
275 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  32.29 
 
 
264 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
300 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>