94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3737 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  96.56 
 
 		 287 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  96.18 
 
 		 287 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  91.22 
 
 		 262 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  73.18 
 
 		 268 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  74.52 
 
 		 269 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  72.35 
 
 		 270 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  72.9 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  74.13 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  71.1 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.92 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.53 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 279 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  40 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  41 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  40.61 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.15 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  40.15 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  39.3 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  40 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  38.34 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  38.08 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  32.68 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  37.4 
 
 		 280 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  30.86 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  29.74 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.94 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  34.77 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  31.75 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  32.26 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  31.92 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 292 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.72 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  29.35 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  23.76 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  32.29 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  25.26 
 
 		 388 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  22.33 
 
 		 390 aa  45.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 		 249 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 		 277 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>