24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67215 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  100 
 
 
388 aa  803    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  55.41 
 
 
390 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45970  predicted protein  28.73 
 
 
399 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  25.68 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25.43 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  21.92 
 
 
293 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
262 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  25.26 
 
 
287 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  24.63 
 
 
269 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
268 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  24.74 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  24.74 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  22.73 
 
 
270 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  22.07 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  20.92 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  20.9 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  21.43 
 
 
271 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19620  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
904 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>