134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  97.04 
 
 		 270 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  78.57 
 
 		 267 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  74.35 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  73.86 
 
 		 287 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  73.86 
 
 		 287 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  73.48 
 
 		 262 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  74.25 
 
 		 269 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  69.63 
 
 		 268 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  72.35 
 
 		 262 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.23 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.23 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  38.76 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  38.46 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.47 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  39.08 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  39.08 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  37.4 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  39.69 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  38.7 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  39.08 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  38.7 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  39.33 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  34.52 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  35.94 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  35.06 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  31.03 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.94 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.36 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 292 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  27.69 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  28.06 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25.26 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  23.67 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  33.33 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  25.89 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  22.69 
 
 		 418 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.27 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.58 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  34.44 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  33.33 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  32.29 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>