131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2542 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  89.93 
 
 		 290 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  89.58 
 
 		 290 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  84.72 
 
 		 290 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  67.13 
 
 		 292 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  66.78 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  64.14 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  53.95 
 
 		 294 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  28.19 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.1 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  32.83 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  27.11 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  25.56 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  27.24 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.56 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  25.26 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  26.14 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  27.31 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  28.02 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  25.38 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  25.56 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  26.21 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  25.73 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  26.21 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  24.81 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  25.73 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  24.81 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  24.51 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  24.09 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  23.99 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  25.38 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  27.61 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.87 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  26.39 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  28.64 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  20.93 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  26.5 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.73 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  23.89 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.87 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.37 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  20.21 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.76 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>