176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4532 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  74.05 
 
 
292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  74.05 
 
 
292 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  64.14 
 
 
294 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  65.62 
 
 
290 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  63.54 
 
 
290 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  63.89 
 
 
290 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  65.74 
 
 
294 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
296 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  27.76 
 
 
301 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
261 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
300 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  27.55 
 
 
261 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  27.55 
 
 
261 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  36.56 
 
 
296 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
296 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  29.92 
 
 
287 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  29.13 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  28.91 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
279 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.36 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.24 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  27.24 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  28.52 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.67 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  26.44 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  26.77 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  25.46 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  27.97 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  26.88 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  27.2 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  26.82 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  26.82 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  27.31 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  27.31 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  27.31 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  24.14 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  29 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  27.89 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  25 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  27.64 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  23.95 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.14 
 
 
444 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.18 
 
 
265 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
300 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
393 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.1 
 
 
418 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  23.47 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  26.92 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>