120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2460 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  78.57 
 
 		 270 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  78.15 
 
 		 270 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  74.43 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  73.66 
 
 		 287 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  74.14 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  71.16 
 
 		 268 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  72.9 
 
 		 262 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  74.52 
 
 		 269 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  72.52 
 
 		 262 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  40.64 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  40.64 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  38.08 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.6 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  40.07 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  39.23 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  38.85 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  40.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  36.72 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  40.23 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  39.08 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  34.54 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.16 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  33.2 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.23 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  27.6 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.54 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  28.68 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 289 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  27.91 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 303 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  22.39 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.73 
 
 		 444 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  22.05 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.62 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.58 
 
 		 418 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  22.11 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>