167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3552 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  35.36 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  29.1 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  23.79 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.75 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  23.42 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  27.21 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  26.87 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.79 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.1 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  28.73 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  28.62 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  22.74 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  25.84 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  25.43 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  25.95 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.15 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  25.91 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.98 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  24.57 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  22.78 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  28.62 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  25.42 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  25 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  25.41 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  25.99 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  21.01 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  23.73 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  23.53 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.36 
 
 		 2762 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  21.64 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  25.37 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  24.12 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  21.21 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  26.32 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.7 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  19.12 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>