140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0758 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  32.9 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  27.2 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  25.5 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  25.5 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.49 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  27.13 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  27.51 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  26.85 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  26.61 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  27.52 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.31 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  24.65 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  19.69 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  28.86 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  23.59 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  28.35 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  26.25 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  27.82 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  26.46 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  25.87 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 562 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  25.87 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.46 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  30.69 
 
 		 408 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  23.77 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  26.19 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  22.26 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  22.81 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  20.63 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>