More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0880 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  80.67 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  55.27 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  36.56 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  36.68 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  36.32 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  32.48 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  32.45 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  27.86 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  32.55 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  26.4 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  26.4 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  32.16 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  34.32 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  34.76 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  29.37 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  26.86 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.68 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  29.48 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  36.75 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  33.14 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  36.75 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  34.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  26.15 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  31.84 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.28 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.59 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  31.23 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  30.83 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  33.94 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  33.94 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  47 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  30.55 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  47 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  30.55 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  47 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  35.98 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  41.38 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  44 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  42.06 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  42 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  31.28 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.65 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>