More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2055 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 322 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  55.99 
 
 		 307 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 315 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  35.62 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  38.77 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.51 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.12 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.01 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  25.26 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  34.75 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.08 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  34.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.37 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  35.24 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  32.2 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  33.85 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  32.52 
 
 		 264 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.08 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  26.2 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.33 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.33 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>