More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2094 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 323 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 315 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 264 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.31 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  23.35 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.43 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.43 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.95 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  32.28 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.54 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.33 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  24.22 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  22.4 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  22.1 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.65 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  31.93 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  28.93 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  25.27 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  22.78 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.86 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>