More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2860 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  42.01 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  43.9 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  38.89 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  41.09 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  39.64 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  38.49 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  40.79 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  34.74 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  34.52 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  32.62 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.52 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 607 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  29.18 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 626 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  33.8 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  33.11 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  35.21 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.6 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  34.36 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 448 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 448 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 448 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  33.83 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 421 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 448 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  31.5 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  31.73 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  28.17 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  25.46 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.48 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.48 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  25.48 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>