More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1280 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  541  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  31.75 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  27.35 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  23.81 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  31.78 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  26.07 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  24.89 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  33.87 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  34.11 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.75 
 
 		 494 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 331 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  32.26 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  28.1 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  28.1 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.08 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  31.43 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.67 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  23.86 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  30.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  31.09 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.59 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  22.1 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  30.89 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  31.4 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  32.79 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.34 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.35 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>