More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0207 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  56.1 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  49.07 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  50.66 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49119  predicted protein  32.26 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00923663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.94 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  26.33 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  25.88 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  32.77 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  25.91 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  24.29 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  29.41 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  25.17 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  31.2 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  30.25 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2266  alpha/beta hydrolase fold  21.52 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  30.23 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04160  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.83 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.651285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  31.9 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  31.9 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  30.25 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.74 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 277 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  31.13 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.57 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.57 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.05 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>