More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2340 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  44.24 
 
 
267 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
267 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
263 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 
278 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 
258 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  32.38 
 
 
274 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  29.82 
 
 
322 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  23.62 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
334 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  31.27 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  30.69 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  30.32 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  29.6 
 
 
273 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
278 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  29.39 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  29.39 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.39 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  29.39 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  29.39 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  29.39 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  30.32 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  30.39 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  29.24 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  28.42 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  25.61 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  29.29 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
274 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  27.6 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.89 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>