More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04160  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.651285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  26.13 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  30.63 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.86 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  32.52 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  30.53 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  30.83 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  24.91 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.34 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.56 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
328 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
324 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  26.37 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.1 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  30.65 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49119  predicted protein  25.32 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00923663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  33.65 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  31.71 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  29.32 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  24.45 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  33.33 
 
 
257 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>