More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05450 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  100 
 
 		 412 aa  853    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  59.82 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  61.36 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  56.1 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 		 263 aa  120  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 266 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 267 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49119  predicted protein  28.26 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00923663  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 266 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 277 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 266 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  29.74 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  24.1 
 
 		 312 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 273 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  32.77 
 
 		 273 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  30.25 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  24.5 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25.69 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.57 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  26.79 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  23.73 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  27.53 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  26.07 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  26.07 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  26.07 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  26.87 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  23.08 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  25.27 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  26.07 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  24.45 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  27.27 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  34.78 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  27.27 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  26.43 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  24.48 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>