More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1272 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  83.62 
 
 		 293 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  74.74 
 
 		 323 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  74.06 
 
 		 289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  73.72 
 
 		 289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  60.48 
 
 		 304 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  60.07 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  60.34 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  61.11 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  59.45 
 
 		 298 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  59.72 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  59.72 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  59.72 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 325 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 421 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 448 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 448 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 448 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  62.12 
 
 		 448 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  58.42 
 
 		 304 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  62.12 
 
 		 301 aa  338  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  56.36 
 
 		 296 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  53.9 
 
 		 626 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 607 aa  313  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  54.93 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  51.97 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  52.74 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  51.64 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  49.68 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  51.8 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  50.68 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 		 309 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  48.9 
 
 		 335 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  43.66 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  48.58 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.79 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  45.33 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.07 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  32.72 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  38.81 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  38.38 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  39.71 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.23 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.87 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.87 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.27 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.68 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  32.53 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  31.72 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.59 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  26.07 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  27.31 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>