239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1872 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 299 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  51.57 
 
 		 308 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  45.96 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  43.25 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  41.64 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  39.93 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  37.59 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  37.64 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.09 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  33.92 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  36.46 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 607 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.32 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  32.89 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  31.44 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  34.85 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  35.06 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 448 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 448 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 448 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  35.76 
 
 		 448 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 626 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  32.43 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  25.38 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.23 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  26.32 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  30.86 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  26.92 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  26.92 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  26.92 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  26.67 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  24.81 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  24.81 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  24.81 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  24.81 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>