More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1561 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 306 aa  620  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  74.91 
 
 		 304 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  70.96 
 
 		 304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  69.57 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  70.39 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  70.55 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  70.39 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  70.39 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  69.83 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  69.83 
 
 		 297 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  66.22 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  66.22 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  66.22 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  66.22 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  66.22 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  65.89 
 
 		 448 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  65.89 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  66.56 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  60.98 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 		 289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  60.84 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  52.88 
 
 		 607 aa  315  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  51.44 
 
 		 626 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  53.36 
 
 		 284 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  49.66 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  51.24 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  45.75 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  45.95 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  45.17 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  45.09 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  41.75 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  39.3 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  38.46 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  34.12 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  32.21 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.54 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  37.2 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.64 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 		 274 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.81 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  29.96 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  22.66 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  26.42 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  26.42 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.27 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>