More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0851 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  51.57 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  44.89 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  42.39 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.68 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  37.92 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  36.27 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.25 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 		 284 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  26.62 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  32.97 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  33.92 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  32.72 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  32.68 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  29.43 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  27.6 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  34.46 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  32.14 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  31.18 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 607 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  27.07 
 
 		 626 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  27.18 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  26.69 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.29 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1620  hypothetical protein  25.84 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>