More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1650 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  98.27 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  87.54 
 
 		 323 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  73.72 
 
 		 294 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  74.66 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  61.81 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  61.81 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  60.84 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  61.11 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  60.76 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  60.76 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  60.76 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  61.05 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  58.6 
 
 		 304 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 421 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 325 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 448 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 448 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 378 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  61.67 
 
 		 448 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  61.32 
 
 		 448 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  59.72 
 
 		 301 aa  338  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  56.21 
 
 		 296 aa  331  9e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  56.29 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  53.14 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  55.2 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  58.45 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  52.48 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  48.56 
 
 		 626 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  52.38 
 
 		 299 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  48.56 
 
 		 607 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  47.62 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  53.71 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  44.68 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  49.29 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  47.69 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  42.11 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  33.46 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  34.62 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  37.37 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  37.5 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.92 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  30.18 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.41 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  36.33 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.92 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.04 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  31.6 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  32.45 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  27.27 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  25.61 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>