240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2855 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
335 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  63.29 
 
 
330 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  62.74 
 
 
311 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  67.36 
 
 
292 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  59.38 
 
 
306 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  59.69 
 
 
299 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
309 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  53.85 
 
 
319 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  53 
 
 
296 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 
300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  52.3 
 
 
323 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  48.9 
 
 
294 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  53.71 
 
 
289 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  53.71 
 
 
289 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
297 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  51.07 
 
 
298 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  45.34 
 
 
304 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  48.93 
 
 
298 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  45.04 
 
 
626 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
421 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
378 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
325 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
448 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
448 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 
448 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 
304 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  47.52 
 
 
323 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  47.7 
 
 
448 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  47.7 
 
 
301 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  43.36 
 
 
607 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
302 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  48.2 
 
 
286 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.4 
 
 
287 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
312 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
283 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  42.31 
 
 
279 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  37.28 
 
 
300 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  37.63 
 
 
300 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.2 
 
 
284 aa  179  7e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  31 
 
 
283 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 
292 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
292 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  40.22 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
295 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  33.82 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
307 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
292 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
302 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
290 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
290 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 
290 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  34.41 
 
 
297 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  34.09 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
299 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  38.96 
 
 
275 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.25 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
274 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
290 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
282 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
298 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 
298 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  34.21 
 
 
295 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  32.82 
 
 
274 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  28.62 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
285 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  38.18 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  24.23 
 
 
2762 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>