More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1544 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
325 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  99.11 
 
 
448 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  99.78 
 
 
448 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
448 aa  900    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
378 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  99.14 
 
 
421 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
448 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  93.36 
 
 
301 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  73.81 
 
 
298 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  73.38 
 
 
297 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  71.43 
 
 
298 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  72.15 
 
 
298 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  72.7 
 
 
298 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  72.15 
 
 
298 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  72.15 
 
 
298 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  67.66 
 
 
304 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  66.22 
 
 
306 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  67 
 
 
304 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  64.58 
 
 
323 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  62.46 
 
 
294 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  62.37 
 
 
289 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  64.6 
 
 
293 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  61.67 
 
 
289 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  54.45 
 
 
296 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  53 
 
 
284 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 
626 aa  289  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 
607 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  51.55 
 
 
323 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  53.36 
 
 
300 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 
311 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  46.28 
 
 
299 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 
330 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  45.54 
 
 
306 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  47.94 
 
 
319 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 
311 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  47.24 
 
 
292 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
309 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  48.06 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
283 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 
312 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 
302 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  38.99 
 
 
300 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  38.41 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  42.49 
 
 
279 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  33.46 
 
 
284 aa  193  6e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  32.95 
 
 
283 aa  190  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.46 
 
 
284 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.15 
 
 
292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
290 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
292 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
290 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 
285 aa  136  8e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.55 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  30.38 
 
 
305 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
290 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
274 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  35.69 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.98 
 
 
274 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
307 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
292 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.51 
 
 
295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
290 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
298 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
298 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
277 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.17 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
301 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  28.96 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
267 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.13 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  28.84 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
239 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  24.32 
 
 
282 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
330 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  23.94 
 
 
282 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
265 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
303 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>