More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2058 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  98.63 
 
 
292 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  70.32 
 
 
295 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  69.72 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 
323 aa  198  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
284 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 
300 aa  181  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
330 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  36.07 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  36.07 
 
 
300 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  42.96 
 
 
311 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
312 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
298 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  39.85 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  40.79 
 
 
296 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  38.68 
 
 
279 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
294 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  38.85 
 
 
299 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
306 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
306 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
335 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  35.4 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  36.59 
 
 
323 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
607 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  35.49 
 
 
304 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
283 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
293 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
626 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
448 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
448 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
448 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  35.15 
 
 
378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  34.81 
 
 
448 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 
309 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  27.24 
 
 
284 aa  136  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 
319 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  34.47 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
274 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  35.56 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
307 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  33.11 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.61 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.21 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
292 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
290 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
282 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  31.21 
 
 
295 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.47 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
299 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
299 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  28.1 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>