More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3920 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  99.28 
 
 
278 aa  567  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  92.09 
 
 
278 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  85.2 
 
 
278 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  83.81 
 
 
278 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  83.45 
 
 
278 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  83.03 
 
 
395 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  83.45 
 
 
278 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  82.67 
 
 
330 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  83.39 
 
 
278 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  84.48 
 
 
278 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  83.75 
 
 
278 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  80.66 
 
 
280 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  80.66 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  80.14 
 
 
278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  79.93 
 
 
280 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  77.74 
 
 
342 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  77.62 
 
 
278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  77.62 
 
 
278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  77.62 
 
 
278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  73.74 
 
 
278 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  73.02 
 
 
278 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  72.56 
 
 
328 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  69.78 
 
 
276 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  72 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  73.09 
 
 
276 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  70.07 
 
 
343 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  67.99 
 
 
276 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  67.99 
 
 
276 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  68.59 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  68.23 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  66.43 
 
 
276 aa  397  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  68.23 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  68.23 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  68.59 
 
 
274 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  67.99 
 
 
276 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  69.23 
 
 
272 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  67.87 
 
 
276 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  67.51 
 
 
276 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  68.59 
 
 
322 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  70.04 
 
 
278 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  66.55 
 
 
276 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  65.7 
 
 
273 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  67.15 
 
 
276 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  65.11 
 
 
274 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  65.7 
 
 
276 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 
276 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  65.7 
 
 
274 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  64.62 
 
 
274 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  65.7 
 
 
274 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  65.7 
 
 
274 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  63.67 
 
 
274 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  66.55 
 
 
274 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 
274 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  63.54 
 
 
274 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  62.09 
 
 
273 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  63.54 
 
 
280 aa  367  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  61.01 
 
 
271 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  60.87 
 
 
273 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  61.01 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  63.04 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  62.32 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  61.37 
 
 
274 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  59.49 
 
 
330 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
317 aa  346  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  60.65 
 
 
273 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 
277 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 
277 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 
277 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  59.21 
 
 
273 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 
274 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  58.48 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  57.91 
 
 
273 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  59.35 
 
 
273 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  57.4 
 
 
273 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  59.78 
 
 
273 aa  331  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  56.88 
 
 
274 aa  330  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  58.48 
 
 
273 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  59.42 
 
 
322 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
324 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 
274 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
290 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
273 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  56.32 
 
 
324 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  56.52 
 
 
322 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  59.06 
 
 
273 aa  321  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  57.61 
 
 
277 aa  321  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  59.06 
 
 
273 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  57.91 
 
 
273 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  59.06 
 
 
273 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  57.04 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  57.04 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  56.68 
 
 
326 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  56.16 
 
 
273 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  55.43 
 
 
274 aa  315  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 
340 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 
338 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  53.68 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  56.2 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  54.71 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>