More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5766 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.14 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  27.03 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.14 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  29.48 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
363 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.43 
 
 
562 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  26.17 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  29.53 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  29.07 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.78 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
292 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  33.51 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
387 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  31.69 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
343 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.83 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.51 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.94 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  29.5 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>