89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13370 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13370  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 
285 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  60.38 
 
 
284 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  60.38 
 
 
284 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  60.38 
 
 
284 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  54.75 
 
 
277 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
404 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
346 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  30.05 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  51.92 
 
 
290 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.35 
 
 
369 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 
374 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.9 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
322 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.86 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.37 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 
255 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.01 
 
 
372 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.9 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.67 
 
 
372 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.5 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.9 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  37.68 
 
 
302 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.8 
 
 
380 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.77 
 
 
370 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
352 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.39 
 
 
371 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  27.72 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
340 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  25.94 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
303 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
311 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
350 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 
312 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  35.29 
 
 
306 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
295 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  26.71 
 
 
312 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.23 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
393 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
262 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 
287 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.04 
 
 
312 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
268 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
311 aa  42  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>