More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4272 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 249 aa  480  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  65.42 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6232  alpha/beta hydrolase fold protein  43.72 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4008  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.951128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.25 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  27.9 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  26.28 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.81 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  25.56 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  26.4 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.27 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  25.18 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.51 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>