More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3661 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  92.46 
 
 
303 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  92.79 
 
 
303 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  94.43 
 
 
298 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  88.74 
 
 
298 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  72.61 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  72.61 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  72.94 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  72.61 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  72.61 
 
 
301 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  72.94 
 
 
301 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  73.36 
 
 
301 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  65.98 
 
 
296 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 
296 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  72.13 
 
 
303 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  62.3 
 
 
301 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  48.03 
 
 
291 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
298 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  43.68 
 
 
300 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 
300 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 
284 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
272 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  44.54 
 
 
284 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
282 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
265 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  34.81 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
265 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.46 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.28 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.59 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  31.64 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.93 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.67 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.37 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.1 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.7 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.52 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.69 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.17 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.62 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.17 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  37.07 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.96 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.7 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  28.28 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.61 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.63 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  41 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>