More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1002 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 292 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  46.26 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  42.61 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 288 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.94 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  26.58 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.5 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.32 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  24.12 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.9 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.1 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.18 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.22 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.27 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.17 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.27 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  24.91 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  24.91 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>