86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4175 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  41.42 
 
 
293 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3533  hypothetical protein  37.23 
 
 
293 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0992  hypothetical protein  36.75 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0826  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599386  normal  0.0336638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  26.51 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  33.76 
 
 
408 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  33.33 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
408 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
408 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4800  hypothetical protein  34.09 
 
 
101 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.98 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
255 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 
294 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.51 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
329 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
315 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1792  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
316 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0957565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.59 
 
 
372 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1974  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
334 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.48 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.29 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
339 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.58 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  32.31 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  24.68 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  25.4 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 
370 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
320 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.66 
 
 
562 aa  42.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>