112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03008 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03008  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  578  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.31 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.31 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.31 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.27 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.64 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.64 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.88 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.03 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.31 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.64 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  22.96 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11990  putative hydrolase  22.14 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  22.94 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  22 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  20.38 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  22.93 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  20.55 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  20.55 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  20.08 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  20.66 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  20.33 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1865  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  20.16 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  20.73 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  19.41 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  20.18 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  20.32 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  19.84 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  20.73 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  18.67 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  20.38 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  21 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  18.59 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  20.24 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  21.51 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3803  alpha/beta hydrolase fold  21.26 
 
 		 409 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  18.47 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  18.47 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  18.47 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  20.26 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  20.55 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  21.79 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  22.42 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  21.61 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  21.4 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  20.74 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  20.8 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  22.82 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  19.62 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  23.11 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  22.4 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  18.87 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  25.11 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  20.38 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  20.07 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  24 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  21.98 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  20 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  20.71 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  21.03 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  20.87 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  20.87 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>