265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11990  putative hydrolase  100 
 
 		 407 aa  800    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  95.09 
 
 		 407 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3803  alpha/beta hydrolase fold  68.86 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03008  hypothetical protein  23.28 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.2 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.71 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  26.23 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  25.87 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 562 aa  57  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.72 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.31 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.5 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  21.53 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.66 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.71 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  26.92 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.17 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 263 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.31 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 269 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.5 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 298 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.14 
 
 		 265 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 251 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  28.75 
 
 		 262 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 297 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.74 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  20.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.77 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 278 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.89 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  24.39 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  21.89 
 
 		 279 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 260 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.13 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.14 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 267 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.93 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 264 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 265 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 309 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 		 261 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 256 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 252 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 256 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.1 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.82 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.82 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.52 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.82 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  25.31 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.91 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>