180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  100 
 
 		 300 aa  624  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  92.33 
 
 		 300 aa  583  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  60.49 
 
 		 295 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 		 295 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 		 295 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  61.68 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  60.66 
 
 		 295 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  55.11 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  55.27 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.29 
 
 		 287 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  50.4 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  43.32 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  43.32 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  43.32 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  43.32 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.96 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  44.36 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  44.33 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  45.63 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  45.63 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  45.63 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  45.63 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  33.2 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  23.88 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.39 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  20.97 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  22.57 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  25.35 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  22.3 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  24.8 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  22.33 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  28 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  28 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  22.76 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  28 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  28 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  22.4 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  23.31 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  22.74 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  23.31 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  23.31 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  29.58 
 
 		 429 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  29.58 
 
 		 429 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  22.4 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  29.58 
 
 		 429 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.09 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  22.47 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.24 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  23.17 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  21.77 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.68 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  20.34 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  22.47 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  22.51 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  24.69 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.09 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  20.26 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  26.44 
 
 		 2082 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.24 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  21.45 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.7 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  21.45 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  29.17 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>