73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1334 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  617  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  70.51 
 
 		 295 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  69.15 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  69.15 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  69.59 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  66.44 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  65.65 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  57.66 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  57.3 
 
 		 300 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  51.86 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.81 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  50.41 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  44.61 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  42.52 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.81 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.81 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.81 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.81 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.57 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.57 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.57 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.44 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.44 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.57 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.44 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  40.44 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.07 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.07 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.07 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.07 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  40.44 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  40.44 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  40.44 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  42.53 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  39.71 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  36 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  21.07 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.64 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27.14 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.85 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  21.74 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  23.67 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  19.16 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  19.16 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  19.16 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.47 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  24.04 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11990  putative hydrolase  22.06 
 
 		 407 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.28 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  20.9 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  22 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.1 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.1 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  26.8 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.1 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  35 
 
 		 524 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  20.49 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>