93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5034 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  99.33 
 
 
300 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  92 
 
 
300 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  91.67 
 
 
300 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  91.67 
 
 
300 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  91.33 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  77.86 
 
 
299 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.14 
 
 
299 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  77.14 
 
 
299 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  77.86 
 
 
299 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.14 
 
 
299 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  77.5 
 
 
299 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  77.14 
 
 
299 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.67 
 
 
278 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.67 
 
 
278 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.67 
 
 
278 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.67 
 
 
278 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.06 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  43.22 
 
 
272 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.38 
 
 
258 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  45.29 
 
 
295 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
296 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
295 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 
272 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
295 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  43.84 
 
 
295 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
295 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  43.38 
 
 
300 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  42.28 
 
 
300 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  40.29 
 
 
294 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  39.34 
 
 
293 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  33.61 
 
 
292 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  24.59 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  48.84 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.44 
 
 
279 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
291 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
252 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  25.51 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  40.58 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.96 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
262 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.35 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.35 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  24.28 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.35 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.9 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  23.64 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  22.44 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  22.49 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  24.81 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  22.84 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.62 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  23.11 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  21.9 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.58 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.22 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  21.74 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>