98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4248 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  100 
 
 		 294 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  82.65 
 
 		 293 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  64.73 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  64.73 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  64.13 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  64.73 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  54.9 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  55.27 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  46.15 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.41 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  41.38 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  41.03 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.28 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.93 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.93 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  40.93 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.93 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.8 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.8 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.8 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.8 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  39.56 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  39.56 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  39.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  38.85 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  36.33 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  20.94 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  19.07 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  23.24 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  21.99 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  22.22 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.82 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  21.69 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  21.79 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  22.54 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.52 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  24 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  25 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.14 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.05 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.34 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  22.47 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  22.83 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  20.58 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  20.61 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  20.58 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  22.01 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  20.58 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  21.14 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  22.08 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  20.33 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.17 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  23.58 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  21.76 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  24.69 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  22.88 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  26.85 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.53 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.53 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.53 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>