63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5185 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  99.33 
 
 
300 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
300 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  99.33 
 
 
300 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  92 
 
 
300 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  91.33 
 
 
300 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  94.33 
 
 
300 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.83 
 
 
299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  73.83 
 
 
299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  76.79 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  76.79 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  73.49 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.29 
 
 
278 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.29 
 
 
278 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.29 
 
 
278 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  73.29 
 
 
278 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.29 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  50 
 
 
258 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  42.49 
 
 
272 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
272 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  44.73 
 
 
295 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
296 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
295 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  44.07 
 
 
295 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  44.12 
 
 
300 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  43.01 
 
 
300 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
295 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 
294 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  39.72 
 
 
294 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  37.68 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  32.95 
 
 
292 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.19 
 
 
265 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
271 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  38.57 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.33 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  23.64 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  43.18 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.05 
 
 
279 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  24.59 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.57 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>