85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  100 
 
 
295 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  95.59 
 
 
295 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.53 
 
 
287 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  48.33 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.96 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  51.74 
 
 
258 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.96 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  47.96 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.96 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.58 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  47.58 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  44.31 
 
 
272 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  44.33 
 
 
300 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.37 
 
 
278 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.37 
 
 
278 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.37 
 
 
278 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.37 
 
 
278 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  44.49 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  42.71 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
295 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
300 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
295 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  44.61 
 
 
296 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
294 aa  234  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  44.36 
 
 
300 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 
272 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  44.07 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  43.38 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  43.38 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 
295 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  41.03 
 
 
294 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  42.14 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  31.56 
 
 
292 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  23.6 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  24.91 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  21.15 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  21.15 
 
 
359 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
284 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  24.28 
 
 
407 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
258 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.33 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  22.14 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.24 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  21.01 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.57 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.31 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.64 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  26.45 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  23.53 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  21.3 
 
 
356 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  21.4 
 
 
323 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  21.3 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>