40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2287 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  100 
 
 
292 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 
296 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
295 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
295 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  36.47 
 
 
293 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
294 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  36.33 
 
 
294 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  35.51 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  33.2 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  31.56 
 
 
295 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  37.93 
 
 
287 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  38.6 
 
 
258 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  31.91 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  33.06 
 
 
299 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  33.06 
 
 
299 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 
300 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  32.95 
 
 
300 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
278 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
278 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
278 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
278 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.84 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.84 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  31.98 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  31.84 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  31.84 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.52 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>