84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3299 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  100 
 
 		 258 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  92.25 
 
 		 287 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  51.76 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 		 295 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 		 295 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  51.61 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  50.4 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 		 295 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  50.4 
 
 		 300 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  50.41 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  49.8 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  49.8 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  49.39 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  49.39 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  49.39 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  49.39 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  48.99 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  48.98 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  48.98 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  49.38 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  49.38 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  51.74 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  50.41 
 
 		 295 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.41 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  46.09 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.35 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  38.6 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.61 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  23.98 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  24.59 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  23.24 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  24.38 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  24.88 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  21.2 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  23.01 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  22.91 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  20.68 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  20.4 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.58 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.43 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.37 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.77 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  33.77 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.57 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  30.21 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  24.05 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.6 
 
 		 253 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>